Eu gosto mais do jQuery acho ele mais leve, mais funcional e com efeitos melhores.
Vou mostrar como substituir o Prototype e colocar o jQuery no seu lugar.
Instalação do plugin jRails:
ruby script/plugin install http://ennerchi.googlecode.com/svn/trunk/plugins/jrails
No layout da sua aplicação remova o uso do Prototype, remova a linha abaixo, caso ela exista:
<%= javascript_include_tag :defaults %>
Agora adicionei as bibliotecas javascripts entre as tags heads:
...
<head>
...
<%= javascript_include_tag "jquery" %>
<%= javascript_include_tag "jquery-ui" %>
<%= javascript_include_tag "jrails" %>
</head>
...Pronto! Fazendo isso o jQuery está disponível e compatível com o Ruby on Rails, ou seja, todos os helpers javascript usarão agora o jQuery como framework javascript.
O plugin jRails sobrescreve os helpers javascript para usar o jQuery.
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